Doktorand (gn*) Biologie, Molekularbiologie, Biochemie oder Biotechnologie
(*gn=geschlechtsneutral)
Wir suchen für die Medizinische Klinik D zum nächstmöglichen Zeitpunkt befristet auf 3 Jahre Sie!
In Teilzeit mit 65%
Vergütung nach TV-L E13
In unserem Forschungsprojekt, wollen wir die Rolle von Proteinen der Tight Junctions bei der Pathogenese der polyzystischen Nierenerkrankung analysieren.
Die polyzystische Nierenerkrankung (PKD) ist eine der häufigsten monogenetischen Erkrankungen und i.d.R. auf einen Funktionsverlust primärer Zilien zurück zu führen. Über die letzten Jahre wurde auch gezeigt, dass Proteine der Tight Junctions in dieser Erkrankung eine wichtige Rolle spielen können. Trotzdem ist die Pathogenese der PKD immer noch nicht komplett verstanden, was die Suche nach Therapieansätzen erschwert.
Wir konnten in der Vergangenheit zeigen, dass ein Adapterprotein des Crumbs-Komplexes nicht nur die apikal-basale Polarität und die Formierung der Tight Junctions, sondern auch die Erhaltung von primären Zilien reguliert (Fiedler et al. 2023). Sein kanonischer Bindungspartner, pals1 scheint zusätzlich auch für die Prävention der Tumorzellmetastasierung wichtig zu sein (Weide et al. 2017, Lüttgenau et al. 2021, Harms et al. 2023).
Ziel dieser Arbeit ist es jetzt, den genauen Pathomechanismus zu untersuchen, wie ein Verlust dieser stark konservierten Proteine zu Nierenzysten führen.
Hierzu untersuchen wir sowohl wildtypische (gesunde) Epithelzellen, als auch Tumorzellen, welche teilweise mittels CRISPR / Cas9 genmanipuliert werden (u.a. ein totaler Knock-out der PATJ-Expression), in der 2D- und 3D-Säugetierzellkultur, sowie intestinale- und Nieren-Organoide mit einem konditionellen Knockout von Pals1 / PATJ.
Das Projekt beinhaltet eine Vielfalt von molekularbiologischen (z.B. RT-PCR, Klonierungen, Mutagenese-PCR), biochemischen (Co-Immunpräzipitation, Western Blot, Protein pulldowns, etc.) und zellbiologischen (2D/3D/Organoid-Zellkultur, CRISPR / Cas9-gene editing, Immunostainings, (super resolution) confocale Lasermikroscopie, FLIM / FRET-Experimente, live-imaging, FACS-Analysen) Techniken.
Dieses Projekt wird in Assoziation mit dem SFB1348 (Dynamic Cellular Interfaces) durchgeführt und Sie werden an dem Seminarprogramm des SFB1438 und der Graduiertenschule teilnehmen können.
Wir sind ein dynamisches Team und freuen uns auf nette, teamfähige Unterstützung!
Sie verfügen über einen Master / Diplom in Biologie / Molekularbiologie / Biochemie oder Biotechnologie.
Für weitere Informationen und Bewerbungen, wenden Sie sich bitte an Prof. Dr. Dr. Michael Krahn, T +49 251 83-57052.
Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung über unser Karriereportal bis zum 18.12.2024!
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